দুটো পাতলা স্ট্রিপ না হলে চাপটা কামড়ায় না
টাউন স্কোয়ারের উৎসবে ক্যানভাসের তাবুর নিচে আমি মোটা ডাবল পোস্টারে একটা চৌকো জানালা কাটছি। হাতচাপটা দেখতে সহজ, কিন্তু দুইটা পাতলা স্ট্রিপ ক্লিক করে না বসালে শুধু দাগ ফেলে। একটায় নকশা ছাপা, আরেকটা শক্ত ব্যাকিং, না হলে নকশাটা ঢলে পড়ে।
এই খুঁতখুঁতে হাতচাপটাই ব্যাকটেরিয়ার Cas9 নামের কাঁচির মতো টুলের গল্প। লোকজন জানত এটা RNA আর DNA নিয়ে কাজ করে। কিন্তু এক টুকরো ছোট RNA দিয়ে ঠিক জায়গার ডাবল DNA ধরতে গেলে নিয়ন্ত্রণ থাকে না, টেমপ্লেটটা বারবার সরে যায়।
পরে বোঝা গেল Cas9 আসলে জোড়ায় কাজ চায়। crRNA হলো ছাপা গাইড স্ট্রিপ, যেটা ঠিক নকশা দেখায়। tracrRNA হলো শক্ত ব্যাকিং, যেটা গাইডকে আকারে আটকে রাখে। দুটো লেগে গেলে Cas9 মিল থাকা DNA ধরতে পারে, আর ম্যাগনেসিয়াম থাকলেই কাটা ঠিকমতো চলে। শেখার কথা: গাইড মানে একা স্ট্রিপ না, জোড়া স্ট্রিপ।
তবু Cas9 যেখান-সেখান কাটে না। আগে সে DNA-র পাশে ছোট একটা চিহ্ন খোঁজে, নাম PAM, পোস্টারের রেজিস্ট্রেশন মার্কের মতো। PAM না থাকলে আঁকড়ে ধরে না। PAM পেয়ে গেলে কাছের দিকের মিলটা খুব কড়া করে দেখে; দূরের দিকে কিছু অমিল কখনও কখনও চোখ এড়ায়।
Cas9 যখন একবার ঠিক করে ফেলে, তখন ডাবল DNA-র দুই দিকই কাটে। একই টুলের ভেতরে দুইটা কাটার অংশ থাকে, যেন হাতচাপের চোয়ালে দুইটা ব্লেড। এক ব্লেড গাইডের সঙ্গে মিল থাকা দিক কাটে, আরেকটা উল্টো দিক। কাটার জায়গাটা PAM থেকে একটা নির্দিষ্ট দূরত্বে পড়ে।
তারপর টুলটা আরও বহনযোগ্য লাগল, কারণ দুইটা RNA স্ট্রিপ জোড়া লাগিয়ে একটাই লম্বা গাইড বানানো গেল, যেন ছাপা গাইড আর শক্ত ব্যাকিং ল্যামিনেট করে এক টুকরো। কিন্তু সব জোড়া গাইড সমান কাজ করে না; কিছু ভাঁজ আর ধরার অংশ Cas9-এর জন্য জরুরি। আর ভিন্ন ব্যাকটেরিয়ার Cas9 নিজের মতো গাইড-আকারই পছন্দ করে।
তাবুর নিচে হাতচাপটা এবার ঠিকঠাক কামড় দিল, জানালাটা পরিষ্কার উঠল। মাথায়ও ছবিটা পরিষ্কার হলো: Cas9-কে চাই ঠিক আকারের গাইড, পাশে PAM চিহ্ন, আর ভেতরের দুই ব্লেড। আগে ব্যাপারটা কপাল মনে হতো, এখন নিয়ম মেনে পছন্দের DNA-তে টুলটা পাঠানো যায়।